Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms