Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms