Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIPQ5VU43 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DIPQ5VU43 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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