Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms