Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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