Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4BQ5PRF9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms