Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF628Q5EBL2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms