Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB3PQ58FF7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB3PQ58FF7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB3PQ58FF7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB3PQ58FF7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB3PQ58FF7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB3PQ58FF7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB3PQ58FF7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB3PQ58FF7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms