Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms