Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LINC01620Q4KN68 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01620Q4KN68 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01620Q4KN68 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01620Q4KN68 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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