Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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KRTAP13-3Q3SY46 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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KRTAP13-3Q3SY46 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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KRTAP13-3Q3SY46 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP13-3Q3SY46 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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