Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC27Q2M243 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms