Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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