Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM187BQ17R55 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms