Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP6Q16828 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP6Q16828 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms