Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCK2Q16822 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCK2Q16822 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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