Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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