Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms