Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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