Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSRP2Q16527 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSRP2Q16527 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms