Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK5Q16478 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK5Q16478 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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