Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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