Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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