Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF13Q15543 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF13Q15543 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF13Q15543 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF13Q15543 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF13Q15543 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF13Q15543 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms