Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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