Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX1-1Q15270 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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