Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNIP1Q15025 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP1Q15025 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms