Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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