Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms