Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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