Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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