Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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