Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCINQ13939 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCINQ13939 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CCINQ13939 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCINQ13939 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCINQ13939 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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