Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1CQ13936 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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