Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXOSC2Q13868 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms