Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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