Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CDH18Q13634 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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