Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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