Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms