Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN3Q13286 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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