Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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