Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms