Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK3Q13003 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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