Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPTFQ12830 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPTFQ12830 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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