Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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GTF3C1Q12789 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GTF3C1Q12789 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GTF3C1Q12789 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GTF3C1Q12789 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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GTF3C1Q12789 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C1Q12789 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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