Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms