Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNA1Q09470 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms