Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms