Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1T1Q06455 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms