Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms